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Le diagnostic anatomopathologique est essentiel.
Il permet de savoir si l'hépatite chronique est active ou non active et s'il existe ou non une cirrhose constituée.
Les lésions sont caractérisées par un infiltrat inflammatoire fait de cellules mononucléées, siégeant dans l'espace porte et la région périportale, une fibrose et une nécrose hépatocytaire plus ou moins notables.
Les lésions de nécrose parcellaire intéressant les hépatocytes de la lame bordante périportale (piece-meal necrosis) sont un signe histologique essentiel des hépatites chroniques. Les lésions histologiques des hépatiques chroniques virales et, en particulier de l'hépatite chronique C, sont souvent modérées, voire minimes.
Certaines anomalies histologiques s'observent plus souvent au cours de l'hépatite chronique C que de l'hépatite chronique B. Il s'agit de la stéatose hépatocytaire, de la présence de nodules lymphoïdes dans les espaces portes et de lésions inflammatoires des canaux biliaires interlobulaires.
Différents scores histologiques sont utilisés :
Le score de Knodell qui apprécie 4 éléments : la nécrose périportale , la nécrose intralobulaire , l'inflammation portale et la fibrose .
Le score Métavir apprécie deux éléments : l'activité et la fibrose.